Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM129A0AVI4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM129A0AVI4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM129A0AVI4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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