Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBNO2Q9Y2G9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms