Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
L1RE1Q9UN81 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms