Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMCC3Q9ULS5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms