Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RAB23Q9ULC3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RAB23Q9ULC3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB23Q9ULC3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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