Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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RABGEF1Q9UJ41 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGEF1Q9UJ41 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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