Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms