Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHORDC1Q9UHD1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHORDC1Q9UHD1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms