Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPC1L1Q9UHC9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms