Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK3Q9UBP4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms