Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP36Q9P275 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms