Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms