Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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