Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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HOXC10Q9NYD6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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HOXC10Q9NYD6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC10Q9NYD6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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