Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
KLHL28Q9NXS3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms