Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIN1Q9NXP7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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