Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RLIMQ9NVW2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms