Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEPPQ9NTK1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEPPQ9NTK1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms