Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LHX9Q9NQ69 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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