Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLCO1B3Q9NPD5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms