Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms