Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SNHG12Q9BXW3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms