Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRRTQ9BXP5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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