Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms