Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLVAPQ9BX97 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms