Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms