Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HIRIP3Q9BW71 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIRIP3Q9BW71 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms