Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM106CQ9BVX2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms