Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM29Q9BSF4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM29Q9BSF4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms