Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP4Q99569 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms