Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TM4SF18Q96CE8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms