Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms