Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms