Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCSTNQ92542 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms