Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms