Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BEST4Q8NFU0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BEST4Q8NFU0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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BEST4Q8NFU0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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