Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CSNK2A3Q8NEV1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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