Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ZNF548Q8NEK5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ZNF548Q8NEK5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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