Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APTXQ7Z2E3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms