Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL1

USP54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, humanhuman

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Length 1,684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54Q70EL1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP54Q70EL1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP54Q70EL1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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