Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms