Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG16L1Q676U5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms