Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms