Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms