Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms