Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGD3Q5JSP0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms