Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC93Q567U6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms