Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ANKRD39Q53RE8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms