Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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