Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC27Q2M243 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC27Q2M243 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms